Központi Szolgáltató Laboratórium

  • A technológiai fejlődés megköveteli a nagyértékű kutatási infrastruktúrát
  • Nagy értékű műszerek optimális kihasználása megköveteli központi elhelyezésüket és sokak számára az elérhetőségüket
  • A felhalmozott tudás disszeminációja nélkül nincs jól működő szolgáltató központ

Szolgáltató laborokkal szemben támasztott követelmények

  • Nyílt, átlátható működés
  • Elérhető műszerhasználat (regisztráció és betanítás függően)
  • Átlátható árképzés
  • Elérhető kutatói szakszemélyzet, szaktanácsadás

Küldetésünk

  • A Debreceni Egyetem kutatói és klinikusai számára elérhetővé tenni a genomikai és funkcionális genomikai fejlődés technológiáit, infrastruktúráját és eredményeit
  • Meghonosítani a személyreszabott medicina eszközfeltételeit és elérhetővé tenni a kollegák számára
  • Folyamatos képzéseket tartani a fölállított technológiák megismertetésére

Infrastruktúránk

  • Laboratóriumok (5 db)
  • Biobank tárolók (2 db)
  • Irodák (5 db)
  • Számítógép szoba, Diszkussziós szoba és PhD szoba
  • QPCR készülékek (2 db)
  • Kapilláris szekvenáló (1 db)
  • Pipettázó robotok (3 db)
  • Mikroarray rendszerek (1 db)
  • DNS/RNS mérési eszközök (Agilent Bioanalyzer, Nanodrop stb) (2 + 1 db)
  • Képzett személyzet:
    • Kutatók (6 fő)
    • PhD hallgatók (4 fő)
    • Laborasszisztensek (6 fő)
    • Projekt menedzsment, menedzser asszisztens (1 fő)

Szolgáltatásaink

  1. Biobanking
  2. Génexpressziós vizsgálatok
    • Affymetrix, globális génexpressziós vizsgálatok
    • Egyedi génekre és miRNS-ekre assay tervezés
  3. Funkcionális genomikai vizsgálatok:
    • Kromatin Immunprecipitáció (1,6ml és 96 lyukú platen)
    • DNS metiláció vizsgálat-MEDIP
  4. Klónozási, fehérje tisztítási szolgáltatások (terv)

Fejlesztéseink

  • UPL alapú mérési rendszerek (QPCR és miRNS: http://mirnadesigntool.astridresearch.com)
  • Nagy áteresztő képességű új generációs szekvenálási techonlógiák (DNS metilációs és epigenetikai profilírozás)
  • Fehérje/ antitest előállítási szolgáltatás

Egyetemi munkacsoportoknak biztosított szolgáltatásaink (2011-2012)

  • Affymetrix génexpressziós vizsgálatok
  • Könyvtár készítés ChIP Seq-hez ILLUMINA NGS
  • Affymetrix citogenetikai vizsgálatok
  • Egyedi génekre és miRNS-ekre assay tervezés
  • Kapilláris szekvenálás
  • QPCR infrastruktúra biztosítása
  • Klónozási, fehérje tisztítási szolgáltatások

2012-ben induló ÚJ szolgáltatásaink egyetemi munkacsoportoknak

  • Bakteriális munkákhoz reagens biztosítás
    • Bakteriális plate (Ampicillin vagy kérésre egyéb antibiotikum)
    • LB (Luria Broth)
    • Ultrakompetens sejtek (E.col DH5alfa)
  • Transzfekciós munkákhoz reagens biztosítás
    • PEI transzfekciós oldat és protokoll
    • D-Luciferin
  • Citokinek
    • IL4
    • LIF
    • GMCSF
  • QPCR reagensek
    • PCR platek
    • 2xMastermix
    • Universal probe library assayk
    • Sybrgreen és ROX festékek
    • QPCR assayk
  • Nukleinsav mérések
    • Qubit reagensek
    • Agilent Bioanalyzer reagensek

Kapcsolódó dokumentum: Core Facility beszámoló, 2012